湾区流式技术经验与平台管理交流会成功举办
2023-07-13 新闻动态
大会报告包括了最新流式科研应用成果、流式新技术、流式数据处理以及流式平台管理四个方面的内容。圆桌会议邀请了近二十家高校、科研院所和医疗机构的平台技术人员,畅谈平台建设经验与困难,共商平台发展提升途径,建立了湾区流式平台互助互通的交流群组。参会人员实地参观了深圳湾实验室的公共技术平台,平台场地规划、人员配置和硬件建设水平得到专家的充分肯定。
圆桌会议
深圳湾实验室主任助理郑波研究员代表深圳湾实验室欢迎莅临会议的专家学者,并感谢大家对流式领域的关注和和对深圳湾实验室的支持,共同探讨和分享流式细胞术的新技术、新应用、有代表性的研究成果和平台管理经验。
流式科研应用成果
从左往右依次为:张政、高伊昉、盛剑鹏
会议上,深圳市第三人民医院研究所所长张政教授,中山大学附属第一医院高伊昉教授,浙江大学医学院附属第一医院盛剑鹏研究员分别分享了他们在各自研究领域的最新应用。
张政教授团队在新冠爆发的几年间,利用单细胞组学技术技术深入揭示了COVID-19重症化的分子机理,免疫保护机制及疾病进展预警指标,阐明了COVID-19重症患者血浆抗体应答规律,并研发出高效抗突变株单克隆中和抗体药物,为新冠肺炎诊疗提供重要方法。
人群生理年龄的衰老常常不能与免疫水平的降低呈紧密相关,高伊昉教授与合作团队通过40️万中国人群外周血免疫细胞表型特征36个参数,结合AI算法建立了免疫年龄评估模型。该模型的建立能够定义和量化中国人群的免疫年龄,对判断临床疾病预后及普通人健康管理有重要意义。
单细胞测序技术应用广泛,但测序结果缺乏空间信息,常表现出基因与蛋白表达水平的不一致。盛建鹏研究员利用成像质谱流式技术,以肠炎组织为模型,进行了空间单细胞多组学研究,描绘了多细胞组成的拓扑微单元,包含了空间位置、细胞互作、转录组、蛋白组信息。基于40种标志物描绘了肠炎组织拓扑学的图景。
流式新技术
从左往右依次为:丁熙来、俞珺璟、张蕾
光谱流式和质谱流式是近年来新兴的进行多参数检测的流式技术。常用来检测复杂样本,深度揭示免疫分群等信息。
来自清华大学蛋白质研究技术中心刘春春,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心细胞分析技术平台副主任俞珺璟,西湖大学生物医学实验中心流式平台主管丁熙来分别针对光谱流式的上下游,讲解了多色流式方案的设计优化,实体组织样本制备及流式检测,并通过光谱与传统流式的对比实验展示了光谱流式在多色检测上的优势。丁熙来还介绍了光谱流式应用中一种染色的新方法,为提高荧光染料的检测通道数提供了新颖的思路。
厦门大学生命科学学院实验服务中心副主任张蕾介绍了质谱流式仪器的管理和应用。从悬液检测模式到成像模式,张蕾讲解了质谱流式如何解决传统流式所面临的瓶颈,样本制备和数据检测所面临的挑战以及解决方案,并重点讲解了质谱流式在免疫学和药物研发上的应用。
从左往右、从上到下依次为:马清华、苏芳、吴永强、缪祥
针对如何保证流式数据的稳定可靠,西南医院马清华介绍了流式检测标准化。中山大学孙逸仙纪念医院流式平台主管苏芳介绍了流式分选必备软技能和硬实力。两位老师细致的讲解让与会人员深受启发,规范标准的实验准备与仪器操作是获得可重复性数据的重要前提。
对于新兴流式技术所产生的海量数据,如何直观,准确,多角度的展示,是研究人员关注的问题。CytoBank高级流式应用技术支持吴永强介绍了高维流式数据分析。他详细介绍了viSNE、tSNE-CUDA、opt-SNE、UMAP等高维数据的降维算法,用于可视化数据的整体结构,并识别细胞群的变化。还介绍了用于细胞分群,发掘细胞异质性的聚类算法工具FlowSOM和CITRUS等。高维流式数据分析工具能帮助研究者从新的角度挖掘更深入的数据信息。针对流式细胞数据质控问题,中国科学院上海营养与健康所缪祥详细介绍了根据实验特点如何判断发现数据造假,规避错误数据产生的假阳性,以及不同流式技巧带来的数据差异,并深入讲解了发表规范数据所需要的对照实验等,引起了听众的广泛共鸣。
流式平台管理
冯倩倩
在平台建设管理方面,具有多年平台建设管理经验的清华大学生物医学测试中心副主任冯倩倩分享了公共科研平台流式技术队伍建设与全时开放共享。她以清华大学生物医学测试中心建设模式为例,介绍了包括技术队伍结构、趋同管理模式、技术队伍培训、全时开放共享服务机制等内容。冯倩倩强调,一流的公共科研平台与技术服务需要一批技术精湛的专职技术人员,提高技术人员待遇,增强自信心,拥有成就感,获得归属感是稳定技术队伍和做好平台技术支撑的关键。
本次会议由深圳湾实验室平台部生化分析平台牵头,会议组织过程中获得了深圳湾实验室各部门的大力支持。会议的成功举办得益于国内流式领域资深专家的支持与帮助。大会为流式从业人员创造了学习与交流的重要机会,获得了业内同行的广泛认可。同时为深圳湾实验室公共技术平台亮出了耀眼的名片。
撰稿 | 平台部生化分析平台
编辑 | 鲍 啦