高性能计算与信息平台
高性能计算与信息平台(简称:计算平台)是以“IT+BT”融合为特色的生物医学研究机构不可或缺的大型基础设施。各类高通量技术的进步,使得基因组、转录组、蛋白组、生命暗物质等数据快速产生和积累,并以序列、结构、细胞、影像、表型、文本等多种模态呈现。要揭示海量数据中所蕴含的健康和疾病的密码,需要采用“数据驱动”的科研范式对其深入挖掘,而数据挖掘过程中所需的存储、处理、整合等工作,则会消耗大量的算力和存储。另一方面,对生命体系中的分子性质和反应机理的理解和预测、对大分子和复合物结构及动态的建模和模拟、对药物分子的虚拟筛选和设计,往往依赖于量子力学方法、牛顿力学方法、或者基于统计经验的理论计算方法,而这些都是计算极端密集型的研究手段。此外,飞速发展的AI技术也在各研究领域得到广泛应用,而本地化训练和部署生物医学领域的各种AI模型,同样需要海量的智算算力。
计算平台配备高性能计算集群和相关科学计算软件,面向理论化学、分子模拟、生物信息学、计算生物学、药物设计、医学影像、AI等研究和应用领域,提供多层次的“干实验”服务。
服务内容:
1. 高性能计算的算力和存储服务
2. 科学计算软件和分析流程的安装、配置和用户日常使用支持
3. 为分子科学计算软件开发等重大项目提供支撑
4. 个性化的数据分析、科研合作等服务
资源配置:
1. 硬件:~2万个 X86 CPU核心,74张GPU卡
2. 算力:CPU 双精度 1.7 PFLOPS,GPU 双精度 0.6 PFLOPS
3. 存储:DDN Lustre 4.3 PiB,浪潮全闪GPFS 440 TiB,曙光NAS 1.5 PiB
4. 网络:Infiniband EDR 100Gbps
高性能计算与信息平台网址:http://hpc.szbl.ac.cn (仅供内网和SZBL VPN访问)
联系方式
联系人:叶志强
联系邮箱:yezq AT szbl.ac.cn